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宏转录组学
仪器型号：
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项目介绍宏转录组是特定时期、环境样本、组织样本中所有的微生物的RNA（转录本）的集合。通过对这些转录本进行大规模高通量测序，可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不仅具有宏基因组技术的全部优点，可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究，还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径，揭示微生物在不同环境压力下的适应机制，探索环境与微生物之间的互作机理。
样品要求
1. cDNA：浓度≥20 ng/μL，总量≥1 μg，必须是双链cDNA；
2. RNA：浓度≥100 ng/μL，总量≥4 μg，并确保RNA无降解；
3. 土壤、污泥等原样，至少提供1.5g；
4. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时干冰运输。
结果展示
群落Bar图:展现不同样本中优势物种/功能的丰度变化
差异表达Volcano图：展现不同组别中显著上下调的基因
常见问题-
宏转录组测序有哪些特点？
1、直接对群落样本中的转录本进行测序，真实再现群落的活性功能；
2、业界公认的总RNA 提取方法和rRNA 去除技术，稳定；
3、使用Illumina NovaSeq高通量测序平台，速度更快周期更短；
4、功能+物种，双管齐下；拼接+不拼接，各取所长，实现对物种和功能的“高分辨率”精确定量；
5、根据样本、数据特征，自动选择分析流程，多种功能注释数据库可选，优化宏基因组功能代谢谱注释；
6、通过多种多变量统计分析和机器学习方法，系统、深入地挖掘宏转录组大数据中差异相关的关键物种和关键功能，识别关键生物标记物。
技术顾问
赵工 15757137609
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