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微生物多样性分析
仪器型号：
16s rDNA测序，18s rDNA测序，ITS测序，微生物群落分析，等
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服务周期：15个工作日
项目介绍微生物多样性测序（又称扩增子测序），是指利用二代/三代测序平台，对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段的 PCR 产物进行高通量测序，突破传统方法不可培养微生物的缺点，获得土壤、水体等环境，以及人体、动物等样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与宿主的相关性等信息。与传统方法相比，无需纯培养，大大减少了研究的费用、周期并提升了物种丰富度。
样品要求
污泥、土壤采样后置于无菌离心管内，短期可置于-20度，长期置于-80度保存，低温寄送，样品量＞3g
动物粪便及肠道内容物，由于动物体内多种酶类可能会发生生物降解，取样器材尽量灭菌，用无菌离心管装样后寄送，长期保存于-80，干冰寄送，样品量不足时可以多次取样收集，样品量根据具体动物类型决定
水体样品可选用0.22 μm或者0.45 μm的滤膜过滤后寄送滤膜，一般一次送1-2张/样
结果展示
常见问题-
微生物多样性是否能鉴定到菌株的种或者属？测全长和扩增子有什么区别？
一般做二代测序（即扩增子测序）可以鉴定到属，三代一般是测菌的全长，信息量更多一些，有一些种属可以精确到种的信息，但是个别亲缘关系很近的，不一定能鉴别开。
真菌、细菌、古菌全长引物包含区段引物序列（V3V4，IT1区等)，全长可以更准确的物种分类，更多的物种鉴定，能精确定位到“种”水平。
全长测序使用三代测序平台。基于PacBio 测序平台测序，相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序，三代可以获得全长的序列，更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率，还可以提高对于群落组成的鉴定的精度，更加真实的还原样本中微生物群落结构。
技术顾问
赵工 15757137609
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