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实时荧光定量PCR(qPCR)
仪器型号:
美国ABI-Quantstudio 6Flex(定量 PCR仪)
预约次数:
271次
服务周期:
7个工作日
项目介绍

实时荧光定量PCR就是通过对PCR扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PCR反应的进行,PCR反应产物不断累计,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图 。

一般而言,荧光扩增曲线扩增曲线可以分成三个阶段:荧光背景信号阶段,荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光背景信号阶段,扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖,我们无法判断产物量的变化。而在平台期,扩增产物已不再呈指数级的增加。PCR的终产物量与起始模板量之间没有线性关系,所以根据最终的PCR产物量不能计算出起始DNA拷贝数。只有在荧光信号指数扩增阶段,PCR产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,我们可以选择在这个阶段进行定量分析。为了定量和比较的方便,在实时荧光定量PCR技术中引入了两个非常重要的概念:荧光阈值和CT值。荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值,它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上,但一般我们将荧光域值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称为CT值(threshold value)。

CT值与起始模板的关系研究表明,每个模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,CT值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代表Ct值(如图3所示)。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。

 

样品要求

1.寄送样本可以为细胞、细菌、真菌、动植物组织等。为了保证提取的遗传物质足够,样品数尽可能准备充足

2.样品为纯细胞或细菌样,离心后获得沉淀黄豆大小为宜,若样品为水样等未知菌量样本,需要提供至少1L的水样或寄送装有过滤定量水样的滤膜(4°C),干燥寄送,如果其他样品寄送需求,请于指南针工作人员沟通确认!

3.待测样品为RNA样品及cDNA样本,接收后需先进行质检,质检合格的开展后续项目

4.客户需要提供检测基因的序列和引物序列,若基因序列来自文献等其他途径,可以多参考几组,避免引物特异性不足,延长实验周期

5.不接受具有致病性的样品

需要提供

1. 待测样品(原始样品或者RNA或者cDNA,原始样品可由我们代处理,RNA样品及cDNA样本接收后需先进行质检,质检合格的开展后续项目)

2. 提供所需的引物/标准品(也可由平台代设计及合成)

3. 其他所涉及的细胞、试剂盒以及生物耗材等平台都可以有偿提供

 

结果展示

常见问题
  • 绝对定量与相对定量的差别?

    绝对定量:是对未知样品的绝对量(拷贝数)进行测定的方法;通常应用于病毒、细菌、衣原体、支原体的定量检测及转基因食品的检测。

    相对定量:是分别测定目的基因和参比基因的量,再求出对于参比基因的目的基因的相对量,最后再进行样品间相对量的比较。主要用于检测细胞mRNA表达量的变化;比较不同组织的mRNA表达差异;验证基因芯片、siRNA干扰的实验结果。

  • 扩增曲线的荧光信号值低的原因是什么?

    扩增曲线存在问题时,首先应确认基线校正或ROX校正前的原始曲线,扩增曲线的荧光信号值低多数是由于背景荧光信号值过高造成的。如下图所示,A的原始扩增曲线背景荧光信号值约为280,其基线校正后的扩增曲线显示较高的荧光信号值(约500);而B的原始扩增曲线背景荧光信号值可达800,其基线校正后的扩增曲线荧光信号值较低(约150)。使用嵌合荧光法进行检测时,背景荧光信号偏高大多数是由于模板量过高,染料嵌入到初始模板DNA中发出荧光造成的。使用荧光探针法进行检测时,背景荧光信号偏高大多是由于设计的探针质量差使淬灭基团的淬灭作用不充分、报告基团和淬灭基团的搭配不合理、探针的荧光标记效率低等原因造成的。

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赵工 15757137609
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